Reino Unido supera las 600.000 pruebas de COVID-19 secuenciadas genómicamente

Escrito por el julio 3, 2021


La secuenciación genómica ha hecho una contribución crucial a la lucha contra el virus al identificar rápidamente variantes preocupantes, comprender la transmisión y ralentizar su propagación.


  • Más de 600.000 muestras positivas de COVID-19 ya han sido secuenciadas genómicamente
  • La secuenciación proporciona datos invaluables que respaldarán las decisiones para relajar el distanciamiento social en el futuro y ayudarán a monitorear futuras variantes y amenazas de enfermedades infecciosas.
  • El estudio nacional GenOMICC COVID-19 ya ha identificado genes que hacen que las personas sean susceptibles a síntomas graves de COVID-19, pero todavía se requieren voluntarios en una carrera contra el reloj.

El Reino Unido ha superado hoy (viernes 2 de julio) otro hito importante en la lucha contra el COVID-19, con más de 600.000 pruebas positivas de COVID-19 secuenciadas genómicamente.

La fortaleza de la base científica genómica del Reino Unido y la industria de secuenciación de diagnósticos ha permitido al Reino Unido identificar rápidamente variantes de COVID-19 y capturar datos críticos, lo que permite a nuestros científicos rastrear y mantenerse por delante de las mutaciones en el genoma del virus. Se estima que el Reino Unido contribuye con alrededor del 23% de toda la secuenciación de COVID-19 en todo el mundo subida a GISAID.

La secuenciación genómica es un análisis de laboratorio que identifica la composición genética de un virus, lo que permite detectar nuevas variantes o mutaciones en variantes existentes. Alcanzar este hito es testimonio de la extraordinaria experiencia que el Reino Unido tiene en genómica y los esfuerzos de investigadores, científicos y analistas de laboratorio, clínicos y responsables políticos.

Gracias a la capacidad de secuenciación genómica líder en el mundo del Reino Unido, se han detectado rápidamente casos de la variante Delta (B1.617.2), así como otras variantes preocupantes. Esto ha permitido al gobierno desplegar rápidamente apoyo adicional en áreas donde las variantes de preocupación han sido frecuentes, como las pruebas de sobretensión y el rastreo de contactos mejorado, para ayudar a frenar la propagación de variantes al romper las cadenas de transmisión.

Ahora, todo el mundo tiene la oportunidad de contribuir al éxito genómico del Reino Unido. Desde mayo de 2020, un estudio nacional dirigido por la Universidad de Edimburgo como parte del consorcio GenOMICC y en asociación con Genomics England ha estado tratando de averiguar por qué algunas personas que han tenido COVID-19 se enfermaron extremadamente y necesitaron hospitalización, mientras que otras experimentaron menos o ningún síntoma. Hasta la fecha, más de 8.400 personas que dieron positivo con COVID-19 pero no necesitaron ir al hospital se han ofrecido como voluntarias para participar.

Los resultados preliminares del estudio ya han identificado posibles nuevos tratamientos para combatir el virus, que se encuentran en ensayos clínicos. Sin embargo, con el cierre del estudio el 30 de septiembre de 2021, los científicos necesitan urgentemente reclutar a 600 personas más y están apelando a aquellos que han tenido el virus pero no requirieron tratamiento hospitalario para inscribirse. Los investigadores están particularmente interesados en escuchar a los hombres y a los de grupos étnicos minoritarios, ya que estas son las personas que se vieron más gravemente afectadas y terminaron en el hospital.

El secretario de Salud y Asistencia Social, Sajid Javid, dijo:

El Reino Unido tiene una historia establecida de científicos que desarrollan una increíble tecnología genómica que se esfuerza por mejorar los resultados de los pacientes en todo el mundo. Cada prueba secuenciada nos ayuda a aprender más sobre este terrible virus, y nos acerca un paso más a derrotarlo.

Las pruebas de sobretensión se han implementado en áreas específicas de todo el país para monitorear y suprimir la propagación de COVID-19 y comprender mejor las nuevas variantes. La secuenciación genómica es una parte clave de las pruebas de sobretensión, ya que permite a los científicos continuar identificando variantes de interés, así como cualquier cambio en las variantes conocidas o identificar nuevas variantes emergentes que deben seguirse. Todas las pruebas positivas con una carga viral lo suficientemente alta en los códigos postales de las pruebas de sobretensión y de los sitios de prueba identificados se enviarán para su secuenciación.

Además de las pruebas de sobretensión, el gobierno está proporcionando paquetes de apoyo adicionales para detener la propagación de la variante Delta, que incluye apoyo para aquellos que se autoaislan y actividad para maximizar la aceptación de la vacuna en el área. En áreas donde los datos han demostrado que el apoyo adicional ha ayudado a frenar la propagación inicial de la variante Delta, como Kirklees, este apoyo se está redechando ahora que la tasa de crecimiento del número de casos está en línea con las tasas nacionales y regionales.

Para aumentar nuestra preparación y aumentar nuestras defensas contra las nuevas variantes, hemos respaldado la nueva tecnología para detectar variantes conocidas, conocidas como ‘pruebas de ensayo de genotipo’, que detecta mutaciones que indican variantes conocidas de preocupación en tan solo 48 horas después del resultado positivo de una prueba PCR de COVID-19. Las pruebas de ensayo de genotipo deben usarse después de la PCR,y para detectar el número máximo de casos con variantes, el gobierno utiliza pruebas pcr confirmatorias para obtener resultados positivos de las pruebas de LFD en Inglaterra durante los períodos de menor prevalencia. Las pruebas confirmatorias se utilizan para validar el resultado de la prueba rápida inicial de LFD.

El virus continuará evolucionando naturalmente a medida que se propaga a nivel mundial, pero el Reino Unido continuará utilizando su excelente capacidad genómica, epidemiológica y virología para monitorear todas las variantes para garantizar que las intervenciones de salud pública sean efectivas y proporcionadas.

El científico jefe de Genomics England, el profesor Sir Mark Caulfield, dijo:

Estamos en una carrera contra el reloj para encontrar a otras 600 personas adecuadas para ser voluntarios emparejadas por edad, género y etnia de aquellas personas que se vieron gravemente afectadas y necesitaron tratamiento hospitalario. En particular, necesitamos que más hombres se unan al estudio y miembros de las comunidades asiáticas y negras como aquellas personas que se vieron más afectadas por el COVID-19.

Si dio positivo por COVID-19 pero no necesitó ir al hospital, por favor regístrese. Usted estará haciendo una contribución real para mejorar la atención médica y los resultados para aquellos que están en mayor riesgo por el virus, tanto ahora como en el futuro.

UKHSA chief executive Jenny Harries said:

A medida que sigamos la hoja de ruta del gobierno hacia una forma de vida que se sienta más familiar, la secuenciación de genomas será aún más importante de lo que ya es. Nos permite rastrear cómo el virus está mutando, ayudándonos a responder de manera más efectiva y decisiva a la amenaza de las variantes emergentes y proporcionando información que está ayudando a dar forma a la respuesta a esta pandemia en todo el mundo.

Continuar compartiendo nuestra experiencia en genómica y virología de clase mundial con el mundo será una prioridad clave para la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido.

Estoy enormemente agradecido a aquellos que han trabajado tan duro para llevarnos a este punto. Con cada genoma secuenciado, aprendemos más sobre el virus y equipamos a científicos y expertos en el Reino Unido y en todo el mundo con datos y conocimientos muy necesarios.

Proceso de secuenciación del genoma

La secuenciación genómica ha sido vital para detectar y responder a las cepas emergentes de COVID-19 y variantes preocupantes. Public Health England(PHE) ha monitoreado de cerca cómo el COVID-19 ha cambiado con el tiempo con nuevas variantes, aumentando la comprensión de cómo estos cambios afectan las características del virus y utilizando esta información para evaluar la mayor transmisibilidad de nuevas cepas.

En las primeras etapas de la pandemia, se creó el Consorcio COVID-19 Genomics UK(COG-UK)para entregar secuenciación rápida y a gran escala del virus del genoma completo a los centros locales del NHS y al gobierno. Los datos recopilados por el consorcio han ayudado a las agencias de salud pública a gestionar mejor el brote en el Reino Unido e informar los esfuerzos de desarrollo de vacunas. La secuenciación se está llevando a cabo ahora a través de un programa dentro de UKHSA basado en el trabajo de COG-UK.

Después de la secuenciación, los datos del genoma del virus se combinan con conjuntos de datos clínicos y epidemiológicos para ayudar a guiar las intervenciones y políticas de salud pública del Reino Unido. En el futuro, esta información permitirá evaluar nuevos tratamientos e intervenciones no farmacológicas y proporcionará información sobre la transmisión comunitaria y los brotes. Estos datos también permitirán a los investigadores identificar y evaluar los cambios genéticos emergentes en las variantes conocidas y examinar cómo afectan a la capacidad del virus para transmitirse de persona a persona.

Una parte crítica de nuestra vigilancia genómica es apoyar la seguridad global a través de pruebas a las personas que viajan al extranjero. Los científicos de PHE cargan información de secuencias variantes en GISAID alertando a otros países sobre la presencia de variantes en diferentes regiones globales.

El Programa de Evaluación de Nuevas Variantes del Reino Unido ya está apoyando a los países que hacen uso de la tecnología de secuenciación genómica del Reino Unido para detectar nuevas variantes, proporcionándoles apoyo técnico y mejorando la capacitación de sus científicos.

Antecedentes

Consulte la lista actualizada de áreas en las que se están implementando actualmente las pruebas de sobretensión.

Regístrese para ser voluntario para participar en el estudio GenOMICC. Cualquier persona que desee ser voluntaria para participar en este estudio debe preinscribirse y reservar una cita en línea. Después de registrarse a través del sitio web, los voluntarios pueden hacer una cita para una visita domiciliaria de una enfermera.

Liderazgo del Reino Unido en genómica

La investigación en el Reino Unido ha llevado a descubrimientos que cambian el paradigma en genética, desde el descubrimiento original de la estructura del ADN hasta nuestra participación en el Proyecto genoma humano.

El Reino Unido también ha liderado el camino en la traducción de la investigación seminal en la práctica clínica y la mejora de los resultados de los pacientes. También es el hogar de una extensa infraestructura de investigación genómica y de salud, desde el Biobanco del Reino Unido, establecido en 2006 hasta Genomics England, el NHS England y el Improvement Genomic Medicine Service (GMS).

La genómica es solo un ejemplo del compromiso de este gobierno para impulsar la innovación sanitaria en el Reino Unido, que desempeñará un papel central en su futura resiliencia sanitaria, el crecimiento de su sector de las ciencias de la vida y las medidas para mejorar la atención al paciente.

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